免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)的局限性主要包括:可能检测不到低亲和力和瞬间的相互作用:低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质之间的相互作用可能检测不到,这可能导致某些重要的相互作用被遗漏。不能确保直接相互作用:免疫共沉淀不能保证沉淀的蛋白复合物是由直接相互作用的两种蛋白组成。两种蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中间起桥梁作用。灵敏度限制:免疫共沉淀的灵敏度不如某些其他技术,如亲和色谱,这可能影响到对低丰度蛋白或微弱相互作用的研究。样本纯度要求高:如果将蛋白复合物直接进行质谱分析,需要得到较高纯度和浓度的蛋白复合物样品,这并非易事,并且成本较高。对抗体要求高:用于免疫共沉淀的抗体不是总是与操作相合适,与Western blotting或者 ELISA相比容易出现假阳性反应。IP-Mass技术结合免疫沉淀与质谱分析,研究蛋白互作与差异,助力生物医学研究!山西免疫沉淀CoIP mass spectrometry检测
Co-IP技术虽然广泛应用于蛋白质相互作用的研究,但也存在一些局限性。首先,Co-IP技术的结果可能受到抗体特异性的影响。如果抗体与目标蛋白的结合不够特异,可能导致非特异性蛋白的共沉淀,增加背景噪声。其次,Co-IP技术可能无法检测到低丰度的蛋白质相互作用,因为低丰度蛋白在细胞裂解液中的浓度较低,难以形成稳定的复合物。此外,Co-IP技术还受到样品制备和实验条件的影响。样品中的杂质、降解产物或酶活性等因素都可能干扰实验结果。另外,Co-IP技术只能检测到在细胞裂解时存在的蛋白质相互作用,对于瞬时或动态的相互作用可能无法准确捕捉。因此,在使用Co-IP技术时,需要注意这些局限性,并结合其他实验方法和验证手段,以获得更准确的蛋白质相互作用结果。中国香港相互作用蛋白检测CoIP WBIP-WB实验操作步骤有哪些。
IP-WB(免疫沉淀-Western Blot)实验要点主要包括以下几个步骤:样品制备:确保样品新鲜且未经过多次冻融,以避免蛋白降解。裂解细胞或组织,获得含有目标蛋白及其相互作用伙伴的裂解液。免疫沉淀:选择特异性强的抗体,与目标蛋白结合形成复合物。将复合物与固相载体(如磁珠)结合,通过洗涤去除非特异性结合的杂质。电泳分离:将免疫沉淀得到的蛋白质复合物进行SDS-PAGE凝胶电泳,按照分子量大小分离蛋白质。Western Blot检测:将电泳后的蛋白质转移到固相膜上,利用特异性抗体检测目标蛋白或其相互作用伙伴的存在。通过显色反应可视化目标蛋白,确保特异性结合。结果分析:观察Western Blot结果,分析目标蛋白与其相互作用伙伴的相互作用情况,为后续研究提供依据。
COIP技术优点如下:
相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的,处于天然状态;
蛋白的相互作用是在自然状态下进行的,可以避免人为的影响;
可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。
然而该技术也存在缺点,具体如下:
可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用;
两蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中间起桥梁作用;
须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择后面检测的抗体,所以,若预测不正确,实验就得不到结果,方法本身具有冒险性。 CoIP实验操作要点主要包括哪些。
Co-IP实验的内源检测注意事项如下:首先,确保使用的抗体具有高特异性和亲和力,这是内源检测成功的关键。由于细胞内蛋白表达复杂,非特异性结合可能导致实验结果失真。其次,严格控制实验条件,如细胞裂解和洗涤条件,以避免破坏蛋白质相互作用或引入非特异性蛋白。温和地释放细胞内蛋白,保证释放出的蛋白不被蛋白酶分解,同时实验过程需保持低温。此外,注意样本的采集和处理。样本应尽快处理,避免蛋白降解,同时防止样本在运输过程中温度过高导致变质。另外,结合其他实验方法进行验证,如Western Blot等,以确认Co-IP实验结果的可靠性。综上所述,Co-IP实验的内源检测需要关注抗体选择、实验条件控制、样本处理以及结果验证等方面,以确保实验结果的准确性和可靠性。IP-Mass技术结合免疫沉淀与质谱分析,研究蛋白互作与差异分析,但需注意其局限性与验证!上海免疫沉淀CoIP Western Blot检测
免疫共沉淀实验涵盖样品处理、抗体处理、共沉淀、洗涤及蛋白鉴定,确保精确检测蛋白相互作用。山西免疫沉淀CoIP mass spectrometry检测
结合了抗体的磁珠或树脂(Beads)与样本裂解液孵育,通过”抗原-抗体“之间的免疫作用,诱饵蛋白被吸附在Beads上,与此同时,诱饵蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗涤去掉未结合的蛋白后,再用洗脱缓冲液将互作蛋白复合物从Beads上洗脱下来,得到免疫共沉淀(Co-IP)产物。Co-IP产物既可以用WesternBlot检测已知蛋白,也可以用质谱鉴定未知蛋白。当没有合适的诱饵蛋白抗体时,还可以通过表达融合了Flag标签的诱饵蛋白,利用Flag标签抗体做免疫沉淀。即样本过表达Flag-Bait,经裂解后与anti-Flag珠子孵育,诱饵融合蛋白与Beads结合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再经洗涤、洗脱后,用WB或质谱检测。山西免疫沉淀CoIP mass spectrometry检测