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PNGaseF去糖基化酶基本参数
  • 品牌
  • Genovis
  • 型号
  • L1-F02-025
PNGaseF去糖基化酶企业商机

SialEXO 2-3 在天然条件下水解糖蛋白,在 pH 值范围为 7.0 至 9.0 时显示出活性。该酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。该酶具有 His 标签,分子量为 66 kDa。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高用于离心柱中糖蛋白去唾液酸化的固定化酶。Genovis的SialEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的SialEXO酶,用于糖蛋白的去唾液酸化,而不会被酶污染z终制剂。它水解天然糖蛋白上的唾液酸(α2-3、α2-6 和 α2-8)并释放出聚糖。效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。河南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶

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genovis分析依那西普和曲妥珠单抗游离聚糖:为了确认依那西普和曲妥珠单抗中半乳糖损失的LC-MS数据,进行了释放的N-聚糖分析。标记的N-聚糖的分离清楚地表明了依那西普和曲妥珠单抗上半乳糖的丢失,如半乳糖基化聚糖物种的信号丢失所示。该酶是一种有价值的工具,可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。1. 高效 α-N-乙酰半乳糖胺酶 – 快速、完全去除 Tn-抗原和 α1-3-连接的 GalNAc;2. 实现完全糖基去除,以改善蛋白质表征;3. 可固定在即用型离心柱中。黑龙江冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶SialEXO、FabRICATOR消化去糖基化蛋白,通过中级质谱测定完整质量数。

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Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖:依那西普是一种融合蛋白,由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇,使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性,制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品:(i)携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白,(ii)用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构,以及(iii)用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基, 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品(图1)。作为比较,SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中,以将Fc区与大多数C端糖肽分离,以促进其表征。

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。而用其他岩藻糖酶处理部分去除岩藻糖或根本没有去除。

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当在完整状态下进行分析时,EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖,因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议(在37°C下进行O/N孵育),两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理,并显示数据以供比较。另一方面,N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态,就根本无法接近。因此,这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。用于糖蛋白的去氟糖基化,而不会用酶污染z终制剂。浙江高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

GalNAcEXO酶是可降低样品异质性,用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。河南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶

从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖:Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性,这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中,例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟,并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解,这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。河南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶

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