Illumina优势与局限优势：高通量：Illumina平台可以在单次测序中产生数十亿个读长短的测序数据，提高了测序效率。高精度：Illumina采用的测序化学和光学检测技术，可以实现较高的碱基测序准确率，通常碱基错误率低于1%。成本低廉：随着技术的进步，Illumina测序的成本已大幅下降，使得大规模测序项目更加经济可行。广泛应用：Illumina平台广泛应用于基因组测序、转录组测序、表观遗传学等多个领域。局限：读长较短：Illumina测序的读长一般在50-300bp之间，相对较短，在比如可变剪接中可能存在局限性。真核无参转录组使得我们理解基因调控网络如何响应环境变化和内部信号进行调整。转录组测序周期
长读长RNA测序还可以广泛应用于转录本组装、RNA修饰检测、融合基因的发现等领域。长读长RNA测序技术也为一些基因调控机制和疾病研究提供了新的视角和方法。例如，在研究中，长读长RNA测序可以帮助检测到更多的融合基因事件，为的分子机制研究提供更为的信息。总的来说，长读长RNA测序技术的进步为研究人员提供了更为强大和的工具，帮助他们更好地理解基因表达、基因结构和转录组的复杂性。长读长RNA测序的出现无疑拓展了RNA测序技术的研究范围和深度。转录组测序周期新基因的发现不仅丰富了我们对生物多样性的认识，也为进一步研究它们的功能和潜在应用开辟了道路。
在一项关于某种疾病的研究中，可以首先利用Illumina短读长测序平台对大量样本进行基因表达分析，筛选出与疾病相关的差异表达基因。然后，对于这些关键基因，可以进一步利用长读长RNA-seq进行深入的结构研究，以确定它们在疾病发展中的具体作用。在未来的发展中，我们可以期待长读长RNA-seq技术不断成熟和完善，成本逐渐降低，从而能够更地应用于科研和临床领域。同时，随着新的测序技术和方法的不断涌现，我们也有望看到更多创新的基因研究手段的诞生。
Illumina测序技术是一种性的高通量测序技术，已经成为生命科学研究领域中为广泛应用的测序平台之一。Illumina测序技术的流程主要包括以下几个步骤：文库构建：将DNA样本切成小片段，然后将每个片段的两端与特定的接头连接，形成DNA文库。文库测序：将DNA文库加载到Illumina测序芯片上，进行桥式扩增和同步测序。序列数据处理：对测序得到的原始数据进行处理，包括去除低质量的reads、拼接序列等。数据分析：对处理后的序列数据进行分析，包括基因表达分析、基因突变检测、基因组变异分析等。真核无参转录组测序的具体步骤可能因实验目的、样本类型和研究需求而有所不同。
某些差异基因可能参与了特定的信号通路，其表达变化会影响整个通路的活性；或者它们可能编码关键的蛋白质，直接决定了细胞的功能和表型。此外，差异基因还可以成为我们研究的靶点，为药物研发和策略的制定提供重要依据。我们可以针对这些差异基因设计特异性的药物或手段，以达到干预疾病进程、恢复正常生理功能的目的。然而，尽管RNA-seq技术在不断发展和进步，DGE分析却似乎在某种程度上从未发生实质性的改变。它的基本原理和流程在多年来一直保持相对稳定。这并不意味着它已经过时或不再重要，相反，这恰恰体现了其可靠性和基础性。在实际应用中，真核无参转录组测序已经在多个领域展露头角。转录组测序周期
真核无参转录组测序揭示发育调控网络的结构和功能。转录组测序周期
桥式扩增是指将DNA模板固定在表面上，并用适当引物引导其进行二倍体扩增，形成桥形结构，后续进行测序。具体步骤如下：DNA片段连接和固定：首先，将待测序的DNA样品通过化学处理连接到测序平台上的固定引物上。固定引物通常是亲水性的，能够有效固定DNA分子在平台表面上。桥式扩增：每一个DNA片段都会在平台表面上扩增成桥形结构。这一过程是通过引物的作用，在固定的DNA片段上进行逐一扩增，形成桥形结构。芯片扫描：经过桥式扩增后的DNA桥结构会通过芯片扫描成像，以获取其位置和序列信息。桥式扩增技术的在于将DNA固定在平台上，并通过引物的导向实现二倍体扩增，终形成桥形结构进行测序。这一步骤的高效实现了Illumina测序技术的高通量特性。转录组测序周期
