在PCR实验中,防止非特异性扩增的关键在于优化实验条件和采取一些特定的策略。以下是一些有效的方法:1.**优化引物设计**:引物设计是PCR成功的关键。应确保引物序列具有高度特异性,避免与非目标序列互补。使用在线工具进行引物设计,并进行BLAST搜索以确认特异性。2.**使用热启动PCR**:热启动PCR技术可以抑制室温下的DNA聚合酶活性,减少非特异性扩增。这种方法通过在高温下激起酶的活性,从而在PCR体系配制阶段降低引物与模板或引物与引物之间的非特异性结合。3.**调整Mg2+浓度**:Mg2+浓度对PCR扩增的特异性和产量有重要影响。过高的Mg2+浓度可能导致非特异性扩增,因此需要优化Mg2+浓度以获得比较好的结果。4.**退火温度优化**:退火温度对PCR特异性至关重要。较高的退火温度有助于减少非特异性结合,但过高的退火温度可能会降低引物与模板的结合效率。通常,退火温度设置比引物的Tm值低5°C左右。5.**使用降落PCR**:降落PCR(TouchdownPCR)通过在初始循环中使用较高的退火温度,然后逐渐降低退火温度,从而在PCR开始时减少非特异性扩增,同时在后续循环中保持特异性扩增。FnCas12a需要一个crRNA,而不需要tracrRNA,简化了RNA的设计和构建过程。Recombinant Mouse Fc gamma RIII/CD16 (His Tag)
在比较BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶对于复杂DNA片段扩增的适用性时,以下是一些关键点:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高热稳定性和扩增效率而被应用于常规PCR。它扩增速度为30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,无校正功能,易产生错配碱基。-对于结构复杂的模板,如GC含量高、有二级结构等,TaqPlus可以用于扩增,能有效地扩增10kb以下的片段。-有产品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通过基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具备更强大的扩增性能,适合扩增高度复杂的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高适温度,能够适应更加苛刻的扩增条件,同时消除DNA二级结构,因而能够准确并且均匀地扩增全基因组序列。-BstDNA聚合酶大片段能够优先扩增短片段的DNA,并且能够确保扩增得到的DNA覆盖了整个基因组,连贯并且无偏地扩增所有的遗传位点。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,扩增速度高达10秒/kb,扩增目的片段长达13kb,具有极强的扩增效率的模板适应性,非常适合复杂模板的高保真扩增。
BstDNA聚合酶对dUTP的耐受性对实验结果有以下影响:1.**防止交叉污染**:BstDNA聚合酶具有较高的dUTP耐受性,这意味着它可以在反应体系中添加dUTP/UDG酶防污染系统的情况下工作,有效防止LAMP产物的交叉污染,确保数据的准确性。2.**保持灵敏度和扩增效率**:即使在引入dUTP/UDG酶防污染系统,使用dUTP替换dTTP的情况下,BstDNA聚合酶的灵敏度及扩增效率不受影响。实验数据显示,在反应体系中添加dUTP对BstDNA聚合酶的扩增灵敏度和效率没有负面影响。3.**提高实验的可靠性**:由于BstDNA聚合酶能够在高浓度的dUTP存在下保持活性,这使得它在进行等温扩增时更加可靠,尤其是在需要防止DNA污染的实验中。4.**兼容dUTP/UDG系统**:BstDNA聚合酶对dUTP的耐受性好,高度兼容dUTP/UDG系统,这对于避免交叉污染和提高实验结果的准确性至关重要。综上所述,BstDNA聚合酶的高dUTP耐受性为等温扩增实验提供了一个重要的优势,即在保持高灵敏度和扩增效率的同时,能够有效防止交叉污染,从而提高实验结果的可靠性和准确性。
磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒与传统纯化方法相比具有以下优势:1.**操作简便快捷**:磁珠法纯化过程通常可以在15分钟内完成,包括结合、洗涤和洗脱步骤,无需复杂的离心或抽滤操作。2.**高纯度和高回收率**:磁珠法纯化得到的DNA纯度高,通常回收率可以达到90%以上,适用于100bp以上的DNA片段的纯化,对达到10kb片段DNA的纯化也能保持较好的效果。3.**适用性广**:磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒适用于多种样本类型,包括PCR产物、酶切产物、连接产物等,也适用于低浓度样品的浓缩。4.**安全性高**:操作过程中不涉及酚/氯仿等有毒试剂,更加环保和安全。5.**灵活性**:可以根据实际状况灵活调节磁珠用量,适应不同体积和浓度的样品处理。6.**自动化和高通量**:磁珠法纯化试剂盒适合手工操作,也可用于自动化工作站或核酸自动提取仪,实现高通量操作。7.**温和的条件**:磁珠法条件温和,对DNA的损伤小,适合后续的多种分子生物学实验,如酶切、连接、转化细菌、测序、PCR、杂交等。8.DNA片段适应性**:适用于从150bp到50kb的DNA片段的纯化,能够满足大多数分子生物学实验的需求。
牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一种来源于牛痘病毒的I型真核拓扑异构酶,具有以下功能和应用:1.**功能**:-牛痘DNA拓扑异构酶I可以催化双链DNA分子中单链DNA特定序列位置的磷酸二酯键的断开和连接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能够通过快速的酶切和连接使双链共价闭合环状的正或负超螺旋DNA发生解超螺旋,形成含有较少的正或负超螺旋的双链环状DNA分子。-能够使双链DNA形成绳结(knotting)或解开绳结(unknotting),联结互补的单链环状DNA成为双链环状DNA。2.**应用**:-作为一种DNA重组连接的新型工具酶,用于DNA载体和重组片段的连接、缺刻修复、接头连接等。-适用于TOPO克隆载体的制备、NGS建库中的接头连接等。-在TOPO克隆技术中,DNA拓扑异构酶I同时具有限制酶和连接酶特性,其生物学功能是在复制期间切割并重新连接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制体系反应液、轻柔混匀、37℃孵育15分钟等步骤。4.**储存条件**:-建议在-25~-15℃保存,有效期为3年。5.**注意事项**:-避免起泡或剧烈搅拌、涡旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓扑异构酶I因其独特的功能,在分子生物学研究和基因工程中扮演着重要的角色。在泛素化过程中,首先泛素激起酶E1(Uba1或其他)在ATP的存在下激起泛素分子,形成E1-泛素硫酯中间体。Recombinant Rat MCP-3/CCL7
Probe qPCR Mix (2×)通常含有热启动DNA聚合酶,这种聚合酶在高温下激发,可以减少非特异性扩增 。Recombinant Mouse Fc gamma RIII/CD16 (His Tag)
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸内切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修复酶,但它们之间存在一些关键的区别:1.**活性类型**:-**核酸内切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以释放受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,产生一个脱嘌呤(Apurinic,AP)位点;AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。-**核酸内切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能够切割DNA磷二酯骨架在AP位点处,但不具备δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**识别和切除的受损碱基**:-**核酸内切酶VIII**:可以识别并切除包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲在内的多种受损碱基。-**核酸内切酶III**:主要识别和切除氧化性损伤的嘌呤碱基,如8-氧鸟嘌呤。3.**裂解酶活性**:-**核酸内切酶VIII**:具有β和δ裂解酶活性,而**核酸内切酶III**具有β裂解酶活性。这些区别决定了它们在DNA损伤修复中的作用和应用范围。
Cre重组酶在基因编辑中的操作主要涉及以下几个步骤:1.**识别与结合**:-Cre重组酶首先识别并分别结合两个LoxP序列的两个反向重复序列,形成一个二聚体。2.**四聚体形成**:-两个二聚体互相靠近,形成由四个Cre分子与两个LoxP位点结合形成的四聚体复合物。3.**DNA切割与交换**:-Cre重组酶在每个LoxP位点的间隔序列中引导单链切割,产生带有3’端羟基的断裂。每个LoxP位点的两个单链分别被切割。切割产生的自由3’端与对侧的3’端进行交换和重连,形成Holliday交叉结构。4.**分子重组与解旋**:-Holliday交叉结构通过Cre酶的作用被解旋并重组,形成新的重组产...