分子蒸馏又称为短程蒸馏，它的原理是在高真空度条件下操作，具有蒸馏压力低、操作温度低、受热时间短、分离效率高等优点，特别适用于高分子量、高沸点、高粘度、热敏性及易氧化物系的分离。
分子蒸馏技术作为一种绿色温和的分离技术提纯桉叶精油具有可行性，在纯化过程中，不会对精油有效成分造成破坏，热敏成分不易分解变质，不会发生聚合等现象，可摆脱化学处理方法的束缚，真正保持特性。随着人们追求天然产品、回归自然潮流的兴起，新产品不断出现，分子蒸馏技术必将因其高效质量、条件温和的工艺特点而备受青睐。
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短程蒸馏(又叫分子蒸馏)是一种热分离工艺，用于分离热敏性产物。短程蒸馏的特点是产物停留时间短、工艺蒸发温度低，力求让蒸馏产物受到尽量小的热应力。可见，短程蒸馏是一种非常温和的蒸馏过程。
短程蒸馏配套真空系统，通过降低操作压力，达到降低产物沸点的目的。这是一种连续分离过程，其产物停留时间低至数十秒(而其他常规分离方法的停留时间达到数小时!)。
所以，在常规蒸馏工艺中(无论是连续的循环、膜式蒸馏，还是非连续的批次蒸馏)，由于高温、长停留时间而分解的产品，用短程蒸馏就能够顺利分离。例如，高分子有机化合物用常规蒸馏方法来分离时，较高工艺温度(如超过200℃)会导致其热敏性的分子链裂解。因此高分子有机化合物的分离几乎都会使用短程蒸馏。
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由分子蒸馏的原理可知，其是高真空度下的连续不可逆蒸馏过程，这种特点决定了其相较于常规蒸馏有着***优点。
1、分离温度低
普通蒸馏需要在物料沸点温度进行，而分子蒸馏是根据不同种类的分子逸出液面后的平均自由程不同的性质来实现分离的，因而分子蒸馏可以低于物料沸点进行，这是分子蒸馏与常规蒸馏的本质区别，被分离物料只要存在着温度差就能分离。由于分离温度远低于物质的沸点，分子蒸馏可有效地避免被分离物质受热分解，且效率高。
2、蒸馏压力小，真空度高
由于分子蒸馏设备的特殊结构，系统内真空度较高，压力小于1Pa，根据克拉伯龙方程，压力的减小进一步降低了蒸馏温度，因而可有效避免易氧化物质的氧化分解。另外，对于混合液中的低分子物质(如有机溶剂、臭味物质等)的脱除，分子蒸馏较常规蒸馏有效得多。
3、分离程度高
组分在分子蒸馏条件下具有比常规蒸馏更高的相对挥发度，因而分子蒸馏能够分离常规蒸发、蒸馏所不能分离的组分，而对常规蒸馏能分离的组分，分子蒸馏具有更高的效率。分子蒸馏常被用来分离常规蒸馏难以实现的液体混合物。
分子蒸馏特点
1、普通蒸馏在沸点温度下进行分离，分子蒸馏可以在任何温度下进行，只要冷热两面间存在着温度差，就能达到分离目的。
2、普通蒸馏是蒸发与冷凝的可逆过程，液相和气相间可以形成相平衡状态；而分子蒸馏过程中，从蒸发表面逸出的分子直接飞射到冷凝面上，中间不与其它分子发生碰撞，理论上没有返回蒸发面的可能性，所以，分子蒸馏过程是不可逆的。
3、普通蒸馏有鼓泡、沸腾现象；分子蒸馏过程是液层表面上的自由蒸发，没有鼓泡现象。
4、表示普通蒸馏分离能力的分离因素与组元的蒸汽压之比有关，表示分子蒸馏分离能力的分离因素则与组元的蒸汽压和分子量之比有关，并可由相对蒸发速度求出。
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分子蒸馏的过程
物料从蒸发器的顶部加入，经转子上的料液分布器将其连续均匀地分布在加热面上，随即刮膜器将料液刮成一层极薄、呈湍流状的液膜，并以螺旋状向下推进。在此过程中，从加热面上逸出的轻分子，经过短的路线或几乎未经碰撞就到内置冷凝器上冷凝成液，并沿冷凝器管流下，通过位于蒸发器底部的出料管排出；残液即重分子在加热区下的圆形通道中收集，再通过侧面的出料管中流出。
分子蒸馏的特点
1、普通蒸馏在沸点温度下进行分离，分子蒸馏可以在任何温度下进行，只要冷热两面间存在着温度差，就能达到分离目的。
2、普通蒸馏是蒸发与冷凝的可逆过程，液相和气相间可以形成相平衡状态；而分子蒸馏过程中，从蒸发表面逸出的分子直接飞射到冷凝面上，中间不与其它分子发生碰撞，理论上没有返回蒸发面的可能性，所以，分子蒸馏过程是不可逆的。
3、普通蒸馏有鼓泡、沸腾现象；分子蒸馏过程是液层表面上的自由蒸发，没有鼓泡现象。
4、表示普通蒸馏分离能力的分离因素与组元的蒸汽压之比有关，表示分子蒸馏分离能力的分离因素则与组元的蒸汽压和分子量之比有关，并可由相对蒸发速度求出。
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分子蒸馏和常规蒸馏的区别
1. 蒸馏温度低，分子蒸馏是在远低于沸点的温度下进行操作的，只要存在温度差就可以达到分离目的，这是分子蒸馏与常规蒸馏的本质区别。
2. 蒸馏真空度高， 分子蒸馏装置其内部可以获得很高的真空度，通常分子蒸馏在很低的压强下进行操作，因此物料不易氧化受损。
3. 蒸馏液膜薄，传热效率高。
4. 物料受热时间短，受加热的液面与加冷凝面之间的距离小于轻分子的平均自由程，所以由液面逸出的轻分子几乎未经碰撞就达到冷凝面。
5. 分离程度更高， 分子蒸馏能分离常规不易分开的物质
6. 没有沸腾鼓泡现象，分子蒸馏是液层表面上的自由蒸发，在低压力下进行，液体中无溶解的空气，因此在蒸馏过程中不能使整个液体沸腾，没有鼓泡现象。
7. 无毒、无害、无污染、无残留，可得到纯净安全的产物，且操作工艺简单，设备少。分子蒸馏技术能分离常规蒸馏不易分离的物质。
8. 分子蒸馏设备价格昂贵，分子蒸馏装置必须保证体系压力达到的高真空度，对材料密封要求较高，且蒸发面和冷凝面之间的距离要适中，设备加工难度大，造价高。
9. 产品耗能小，由于分子蒸馏整个分离过热损失少，节省能耗。
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