上海18s高通量测序高通量

简化基因组测序，项目介绍：通过限制性内切酶对基因组DNA进行酶切，并对酶切片段进行高通量测序，这种通过酶切降低基因组的复杂度的测序技术统称为简化基因 组测序技术。利用生物信息学方法，进行SNP单体型图谱绘制，全基因组关联分析（GWAS），连锁分析和QTL定位分析，种群进化，主成分分析等。比较有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因组测序，项目介绍：宏基因组指特定环境样品内全部遗传物质的总和。直接提取环境样品内全部基因组DNA，随后进行大规模高通量测序（shotgun 策 略）。测到数据后，先进行必要的数据质控，而后进行基因组拼接、注释（物种、基因功能），使得我们可以获取环境样品内菌群分布、系统进化、功能代谢等信息。该方法已经得到普遍的运用。RNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子。上海18s高通量测序高通量

微生物基因组重测序（有参）：目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。微生物基因组从头测序（无参）：对于不断分离培养微生物的客户来说，要确定一个菌株是否是新菌株或者新菌种，较快捷的办法就是，直接进行基因组测序。利用高通量测序技术，对这些基因组进行高深度测序，然后进行基因组组装，获得基因组的框架图或者精细图甚至是完成图。从而可以快速解析其基因组结构、基因功能、进化关系。上海地区高通量测序测序特别申明：不能采用过柱离心的方法提取总RNA。

土壤样本请置于2 mL离心管里（多准备几管备用），为保护样本管，样本管置于保护用的50 mL离心管或其他类似容器里，并旋紧盖子；如常温采的样品，可以采用蓝冰运输；如果是高温发酵罐或者样品已经冻存-80°C，需要用足量干冰运输； DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子；蓝冰运输；RNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子；用足量干冰运输。

small RNA测序，项目简介：Small RNA是一类重要的体内调节分子，长度在18-30 nt之间，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量，从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。测序使用Illumina Xten平台，测序原始数据质控后，进行Clean reads 长度分布统计，small RNA注释，已知 miRNA 注释，已知piRNA注释，ncRNA分析，新 miRNA 预测（有参考基因组），差异基因可视化分析，miRNA 家族分析，差异表达 miRNA 聚类分析，miRNA靶基因预测，靶基因GO、KEGG富集分析。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。

什么是KBSeq全质粒测序？它基于第二代测序技术，一次性对大量质粒（比较多可达6000个样本）进行并行测序，利用生物信息学分析，对数据进行序列组装并获得每一个质粒的完整序列信息。所以我们也称它为，可以部分替代一代测序的高通量测序技术。测序长度：对于测序长度较长，如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间，而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天，就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。样本用量：KBSeq全质粒测序对于样本的量，要求的也比较少，比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl，如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的，KBSeq就更为适合了。如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。上海地区全质粒测序高通量测序应用

生工生物接受客户自备文库测序项目。上海18s高通量测序高通量

生工优势：1.生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验，日均处理样品200余例，涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品，省去您处理样品的繁琐过程。2.生物信息分析经验丰富，可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容（以生工分析报告模板为准），全部无费用。3.生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系，可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目。一站式解决问题。上海18s高通量测序高通量

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