反转录酶的注意事项，在进行RT反应之前，应考虑以下几个方面：RNA：成功的cDNA合成来自高质量的RNA，高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂，如EDTA或SDS。在提取RNA的过程中，要特别防止RNase的污染，同时在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂以增加cDNA合成的长度和产量。RNase抑制剂要在首先链cDNA合成反应中，在缓冲液和还原剂（如DTT）存在的条件下加入，因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性，从而释放结合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制剂只防止RNaseA，B，C对RNA的降解，并不能防止皮肤上的RNase，因此尽管使用了这些抑制剂，也要小心不要从手指上引入RNase，实验过程中经常更换新手套。逆转录酶是逆转录过程中的重要酶类。成都miQP2逆转录测序
逆转录引物：加尾法逆转录引物的结构并不是想象中那么简单的oligodT，其包含三个关键结构：①为了与PolyA序列互补配对，OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端，存在一段通用序列，用于qPCR过程中反向引物与cDNA的结合。③OligodT序列的3端存在一个或两个锚定碱基，V或者VN。(兼并碱基，V表示A、G或C，N表示ATCG中的任意一种)。如果没有锚定碱基，逆转录引物中的OligodT就会随机结合到PolyA的任意位置，这样会造成同一miRNA的逆转录产物长度不一，给较后的熔解曲线检测带来麻烦。因此，锚定碱基的作用就是特异性地结合到miRNA上，从而让逆转录引物结合到紧挨着miRNA的那段PolyA序列上。只有这样，才能够保证同一miRNA的逆转录产物大小相同。苏州一步法反转录蛋白检测逆转录技术的发展使RNA研究得到极大便利。
逆转录的发现有重要的理论意义和实践意义。对分子生物学的中心法则进行了修正和补充。经典的中心法则认为：DNA的功能兼有遗传信息的传递和表达，因此，DNA处于生命活动的中心位置。逆转录现象说明：至少在某些生物中，RNA同样兼有遗传信息传递和表达功能。修正后的中心法则表示为：是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。某些病毒中的RNA自我复制和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程（某些致死病毒）。有些亚病毒例如朊病毒，这种亚病毒没有核酸，是一种因错误折叠而形成的结构异常的蛋白质，以蛋白质直接形成蛋白质，可促使与自身具有相同氨基酸序列的蛋白质发生同样的折叠错误，从而导致大量结构异常的蛋白质的形成。当然，一般不认为亚病毒属于生物。
反转录酶的选择：反转录酶（Reversetranscriptase）又称逆转录酶。是以RNA为模板指导dNTP合成互补DNA（cDNA）的酶。一部分反转录酶具有RNA酶活性，能够在转录后降解RNA-DNA杂交链中的RNA链。如果反转录酶没有Rnase酶活性，可加入RNaseH来获得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒（MMLV）反转录酶和禽成髓细胞瘤病毒（AMV）反转录酶。依据RT-PCR，理想的状态下是选择具有较高热稳定性的反转录酶，cDNA的合成才能在较高的温度下进行，确保成功转录具有较高二级结构的RNA，并确保在整个反应过程中的全部活性，从而得到质量更高的cDNA。质粒RNA检测中的逆转录反应需要特定反应体系。
miRNA的加尾法逆转录和qPCR，miRNA与mRNA的在qRT-PCR过程有所不同。一般来讲，mRNA比较长，其长度通常在几百至几千个核苷酸，因此使用随机引物(RandomPrimerp(dN)6)即可随机结合到mRNA的各位置进行逆转录。由于qPCR的过程只需扩增目的片段的一部分(80~200bp)，因此使用随机引物的逆转录产物尽管不完整，也完全能够满足qPCR的需求。当然，也可以使用OligodT引物统一从mRNA的ployA尾巴开始逆转录。这种逆转录引物在扩增cDNA全长时是必须的，但要注意，原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾，因此不能使用OligodT引物进行逆转录。逆转录实验中可以通过qPCR检测逆转录反应效果。成都miQP2逆转录测序
逆转录实验要使用高质量的反转录酶和逆转录引物，避免引物交叉污染。成都miQP2逆转录测序
逆转录酶的质量控制：1.切口酶：在与200单位酶37oC保温60分钟后，超螺旋质粒保留在90%以上。2.DNase测定：200单位酶与50ng3H-DNA37oC保温60分钟，分解出的放射性低于1%。3.RNase测定：200单位酶与50ng3H-RNA37oC保温60分钟，分解出的放射性低于3%。4.首先链cDNA的反应：在标准化的反应中，200单位酶催化从1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA将同位素掺入到cDNA中，通过放射自显影，对于1.2kb的RNA，产物cDNA是单一的、全长的条带。对于7.5kb的RNA产物有部分是全长的条带。用这二种RNA放射性转换到cDNA中有12%。5.RNaseH活性：200单位酶与polyA:polydT37oC保温60分钟，释放出的放射性要低于1%。成都miQP2逆转录测序
