TaqMan探针法是探针分子,TaqMan探针是单链DNA,5’端偶联发光基团,3’端偶联淬灭基团,游离的完整探针是检测不到荧光信号的,发光基团发出的荧光会被淬灭基团吸收淬灭,探针被水解,发光基团和淬灭基团远离就可以检测到荧光信号。反应开始时,模板链经热变性解链形成单链,TaqMan探针优先跟模板链退火,引物随后退火到模板上,之后进行链的延伸,延伸过程中Taq酶发挥5’-3’外切酶活性,遇到探针会从5’端逐个碱基切除探针,发光基团会跟淬灭基团分开,因此荧光检测系统可以接收到荧光信号,每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号的累积和PCR产物形成是同步的。TaqMan探针法的特异性除了由引物提供,更由探针分子保证,因其退火温度更高,所以TaqMan探针法特异性更好,在一个反应体系中加入多条探针,可以做多个基因同时检测。q225pcr无需参比染料、无需定期校准,更加简化的操作流程与减轻的维护负担只为更好地专注于实验。苏州准确qPCR仪厂家
Taqman探针是由5’端标记有荧光报告基团和3’端标记有淬灭基团以及与目标基因特异性结合的寡核苷酸序列组成。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收,此时仪器不会检测到荧光信号。在PCR扩增时,模板DNA变性解链,Taqman探针特异性结合到目标基因处,而Taq酶具有5’-3’核酸外切酶活性,延伸至探针结合处,可将探针水解,使荧光报告基团和淬灭基团分离,从而检测到荧光信号,荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比。荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中dsDNA的浓度。Taqman探针法因其特异性高,被地应用于等位基因鉴别、SNP分型、病原体和病毒检测、疾病耐药基因研究、多重定量等。佛山快速qPCR仪使用说明SYBR Green I 是一种结合于所有双链DNA(dsDNA)双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。
合成引物时需注意:在设计PCR引物时,首先确定要扩增的DNA区域,并设计一对专门位于目标区域的引物,一个在正向链上,另一个在反向链上。引物须具有特异性,避免扩增出非特异性片段。正向引物与反向引物应具有相似的退火温度,GC含量与退火温度相关,调整引物长度可以改变退火温度。避免引物序列有二级结构或引物二聚体,会降低PCR效率。许多的在线工具可用于辅助引物设计。PCR扩增包括三组被设定好的时间和温度,步骤为:变性,退火和延伸1、变性:PCR的第一步称为变性,将模板DNA加热到95°C几秒钟,将两条DNA链分开,使它们之间的氢键迅速断裂。2、退火:反应混合物冷却30秒至1分钟。退火温度通常为50-65°C,但确切的比较好温度取决于引物的长度和顺序。不同的引物可能具有不同的退火温度。3、延伸:温度升至混合物中存在的DNA聚合酶的理想工作温度,通常约为72°C。DNA聚合酶附着在每个引物的一端,并合成与模板DNA互补的DNA新链。
双杂交探针是两个特异性探针,一个只5’端标记荧光基团,另一个只3’端标记猝灭基团。这两个探针序列和模板特异性结合,结合的位置非常邻近。在qPCR反应的退火阶段,当两个探针与模板结合时,位于两个探针头尾的荧光基团之间产生FRET现象,促进受体的荧光基团释放一种波长的荧光信号,从而达到实时监控反应进程的目的。Amplifluor系统包括两个特异性引物和一条检测探针(UniPrimer),其中一条引物的5’末端带有部分序列和UniPrimer的3’末端部分序列相同。UniPrimer两端分别被荧光和淬灭基团标记且有发卡结构。反应时,UniPrimer结合到特异性引物扩增出的模板上作为引物进行PCR反应,在延伸的过程中UniPrimer发夹结构打开,荧光信号释放。蝎形引物为茎环结构,其5’端带有一个荧光基团FAM,3’端带有一个淬灭基团DABCYL,其环的部分序列和模板完全互补配对。体系有模板时,茎环结构稳定,荧光和淬灭基团相距近,不能检出荧光信号;体系无模板时,蝎形引物和模板特异性结合并起始PCR扩增,蝎形引物的环结构与扩增出的模板互补杂交,导致茎环结构被破坏,释放出大量的荧光信号,荧光仪器可以实时收集这些荧光信号并生成相应的荧光扩增曲线。Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。
定量首先需要建立Ct值和拷贝数之间的线性关系,即标准曲线,标曲需要由标准品生成,标准品中基因序列要与待测样品中基因序列一致,从而保证引物在两者中扩增效率完全相同,标准品来源可以是质粒,纯化的PCR产物或者基因组DNA等。标准品在加样时需要注意体积比较好大于2微升,以减少标曲误差,标曲是由不同梯度标准品生成,每个标准品梯度建立Ct值与拷贝数对数值之间的联系,落在标曲上的梯度点比较好有5个及以上,至少3个点。标准品和待测样品同时反应,将待测样品检测的Ct值代入标曲后即可换算出待测样品中基因的拷贝数。实时荧光定量PCR技术有效解决了传统定量只能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度。佛山快速qPCR仪使用说明
荧光检测系统可接收荧光信号,每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号累积和PCR产物形成是同步。苏州准确qPCR仪厂家
qPCR的荧光标记方法分为以SYBR Green I染料法为主的荧光染料嵌合法,以Taqman探针法为主的荧光探针法(Cycling Probe,Molecular Bracon等),淬灭染料引物法。SYBR Green I 是高灵敏度的非特异性双链DNA荧光染料,具有绿色激发波长。它以非特异性方式结合在dsDNA双螺旋小沟区域。游离的SYBR Green I 只发出极弱的荧光信号,PCR过程中,当扩增生成dsDNA时,SYBR Green I 逐渐与dsDNA结合,荧光信号被千倍放大,荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比。荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中dsDNA的浓度。苏州准确qPCR仪厂家
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