土壤柔武士菌

堀越氏芽孢杆菌（Bacillus horikoshii）是20世纪90年代由日本科学家堀越等从碱性温泉沉积物中分离出的嗜碱菌，也是国际公认的模式菌株（ATCC 700161）[ ^82^ ][ ^84^ ]。菌体杆状、革兰氏阳性，可形成椭圆芽孢，更适pH 8.5–9.5、温度30–37 ℃，在Na₂CO₃浓度50 g L⁻¹的极端环境中仍能正常代谢，被称为“天然碱性细胞工厂”。一、耐碱机制基因组编码多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白（mnh、nhaC）和碳酸酐酶，可将胞内多余Na⁺排出，并将CO₃²⁻转化为HCO₃⁻，维持胞内pH稳态；细胞壁肽聚糖含高比例二氨基庚二酸，增强膜稳定性，为高温高碱酶的高效表达提供平台。二、工业酶潜力其耐碱淀粉酶、普鲁兰酶更适pH 9–10，90 ℃半衰期>2 h，已用于淀粉糖化“一步法”，可省略传统工艺中的中和环节，节能15 %；耐碱蛋白酶在洗涤剂中可去除血渍、奶渍，低温活性优于市场同类酶20 %。三、农业与环境应用菌株P1具备“溶磷-钝化重金属”双重功能：在pH 9、Cd²⁺ 50 mg kg⁻¹条件下，仍可将难溶磷酸钙转化为磷277 mg kg⁻¹，同时胞外多糖吸附Cd²⁺，使水稻籽粒镉含量下降35 %，产量提高18 %。

赫氏埃希氏菌是深海热液口的“化学魔术师”，能在摄氏百度、千倍大气压的暗夜里，把硫化氢当早餐，把二氧化碳当点心来款待。它用氢硫还氧酶把剧毒硫化氢拆成电子与质子，驱动ATP合酶高速旋转，合成能量，再借逆三羧酸循环把无机碳织成有机糖，无需阳光，也能养活整片“黑烟囱”丛林。科学家搭乘深潜器采集菌体，发现其细胞膜含特殊醚键脂质，像给自身裹上耐高温的陶瓷瓦，蛋白质内部也布满离子键，仿佛微型钢铁骨架，才让它在沸水中依旧柔韧。实验室里，研究团队把它的固碳基因簇移植到工业大肠杆菌，使后者能在废气流里自养生长，产出的聚羟基脂肪酸酯可制可降解塑料，为碳中和提供新思路。小小赫氏埃希氏菌，用肉眼看不见的臂膀，托住地球深部与未来的绿色循环。岛青霉同时释放挥发性 2,3-丁二醇，启动植物 ISR 信号，使叶片过氧化物酶活性提高 1.8 倍，达到“未病先防”。

MB培养基基础（Marine Broth Base）是一种专为海洋细菌设计的富营养液体培养基，由蛋白胨、酵母粉及多种无机盐组成，pH 7.2–7.6，渗透压与海水相当。配方中氯化钠浓度约2–3%，并补充镁、钾、钙等海水中主要离子，可瞬时启动依赖高盐环境的嗜盐菌与耐盐菌，缩短延滞期。实验室常规做法是将培养基干粉溶解于蒸馏水后，补加陈海水或人工海盐，即可恢复接近自然海水的离子谱，使挑剔的海洋放线菌、弧菌、假单胞菌等迅速进入对数生长，用于后续分离、保藏或活性物质筛选。由于海洋微生物常产色素、抗生物质及胞外多糖，MB培养基的高营养特性可充分展现这些次级代谢潜能：弧菌在28℃、180 r/min振荡培养12小时，菌浓即可达10⁹ CFU/mL，菌液呈乳白或淡粉；某些Planococcus则分泌墨蓝色素，使整瓶培养液变为靛蓝，成为天然色素研究的理想起点。若需固体培养，只需补加1.5%琼脂，即成MBA平板，可在表面涂布沉积物悬液，28℃培养2–3天，挑取形态各异的单菌落进行16S rDNA鉴定，流程简洁高效。在质量控制方面，MB培养基需用人工海水或陈海水配制，切忌直接使用自来水，以免钙镁离子不足或氯残留抑制菌体；灭菌后若出现沉淀，多为镁盐析出，可50℃水浴复溶，不影响使用。

扩散芽孢杆菌（Bacillus diffusus）是芽孢杆菌属里的“运动健将”。菌体杆状、周生鞭毛，在琼脂表面可形成迅速扩展的薄膜状菌落，24 h内直径达80 mm，故得名“diffusus”。其更适生长温度30–37 ℃，pH 6–9，耐干燥、耐紫外，芽孢可存活十年以上，为制剂化提供质量特性。一、快速定殖菌株DSM 13271分泌大量胞外多糖，降低表面张力，使菌体在沙壤土中迁移速度提高3倍；与枯草芽孢杆菌复配，可形成“生物被膜”，优先占据根际生态位，抑制病原菌入侵。二、广谱抑菌扩散芽孢杆菌产生diffusin脂肽，对番茄青枯、辣椒疫霉、棉花黄萎等病原菌抑菌带宽达28 mm；温室试验显示，亩用200 g菌粉滴灌，黄瓜枯萎病指下降45 %，农药用量减少三分之一。三、促生提质菌株IAA产量25 mg·L⁻¹，溶磷2.9 mg·L⁻¹，并产挥发性2,3-丁二醇，诱导玉米侧根增30 %，吸磷量提20 %；新疆盐碱地示范，冬小麦千粒重增1.5 g，产量提高8 %。四、工业酶潜力其耐碱蛋白酶在pH 10、50 ℃下活性比较高，已用于洗涤剂，低温去污力提升25 %；胞外多糖乳化力强，可作为钻井泥浆降滤失剂，耐盐达12 %。其分泌的耐有机溶剂蛋白酶、褐藻胶裂解酶在洗涤、纺织及海藻转化中展现高活性，为生物制造提供新工具。

解糖肠球菌（Enterococcus saccharolyticus）是一种革兰阳性、兼性厌氧的球菌，更早从英国稻草垫料中分离，模式菌株ATCC 43076被广用于API及VITEK®系统的质量控制。该菌因能发酵多种糖类产酸，故得名“解糖”，在分类学上与粪肠球菌、屎肠球菌并列，却极少携带典型毒力基因，安全性较高。近年研究发现，解糖肠球菌具有突出的益生潜力：它可在pH 2.5的胃酸和0.3%胆盐中保持90%存活，并分泌乳酸、乙酸等短链脂肪酸，迅速降低肠道pH，抑制沙门氏菌、大肠杆菌等致病菌的定植。体外试验还显示，该菌能黏附于Caco-2细胞单层，上调紧密连接蛋白ZO-1与Occludin的表达，增强肠屏障功能，减轻脂多糖诱导的炎症反应。在动物应用中，日粮添加10^7 CFU/g解糖肠球菌可显著提高断奶仔猪平均日增重8.7%，降低料重比6.3%，并减少腹泻率一半；其代谢产物还能促进双歧杆菌、乳酸菌等有益菌增殖，使结肠丁酸浓度升高30%，改善绒毛高度与隐窝深度比。此外，该菌对万古霉素敏感，不含vanA/vanB耐药操纵子，降低了基因横向转移风险。综上，解糖肠球菌凭借耐酸耐胆盐、产酸抑菌、增强屏障及促生长等多重功能，被视为替代抗生物质的潜力菌株，未来在婴幼儿食品、畜禽养殖及微生态制剂领域具有广阔前景。其芽孢可抗紫外、耐干燥，货架期长达24个月，为商品化奠定基础。Sphingomonas dokdonensis

整套反应在pH 7、30℃下效率更高，甲醇转化率可达理论值的92%，远高于化学催化。土壤柔武士菌

异常嗜冷芽孢杆菌（Bacillus psychrodurans）是芽孢杆菌属的“极地移民”。标准菌株能在-2 ℃缓慢增殖，更适生长温度只15 ℃，比较高不超过30 ℃；芽孢可耐受-20 ℃反复冻融，是研究低温适应的模式菌之一。其细胞膜富含短链与支链脂肪酸，冷休克蛋白Csp持续表达，使核糖体和RNA在冰水中仍保持活性，为“零度工厂”提供分子基础。在农业端，菌株L-4可分泌IAA 18 mg·L⁻¹并溶出有机磷2.3 mg·L⁻¹，4 ℃下仍使冬小麦根长增加25 %，返青期提前5天，分蘖数提高一成，相当于给作物披上“生物羽绒服”。工业方面，它的耐冷蛋白酶已在洗涤剂中试用，10 ℃洗衣去污力提升30 %，节能20 %；低温淀粉酶可将糖化温度由60 ℃降至35 ℃，为寒区酒精发酵节约大量蒸汽。环境修复更彰显其“冰雪技能”。菌株ANT-1在-5 ℃、10 %盐度下60天降解柴油60 %，为极地溢油、寒区输油管线泄漏提供原位生物修复方案；与冰藻共培养时，还能吸附Cd²⁺、Pb²⁺，吸附量分别达50 mg·g⁻¹和35 mg·g⁻¹，让重金属在冰层中被“冻结”并随菌体沉降。未来，借助合成生物学，把异常嗜冷芽孢杆菌的“冷酶+冷激”模块植入生产底盘，有望实现“零加热”生物制造，让微生物在冰水里也能为人类催化高值反应。土壤柔武士菌